大腸菌に目的の遺伝子を導入する遺伝子組換えの実験では、まず目的の遺伝子を含む DNA と、ベクターとして用いるプラスミドを、同じ酵素で処理して切断する。この酵素は、DNA の特定の塩基配列を認識し、その部分で DNA を切断するはたらきをもつ。切断された DNA 断片どうしは、その後 DNA リガーゼによってつながれる。
このように、DNA の特定の塩基配列を認識して、その部分で DNA を切断する酵素を何というか。
制限酵素・DNA リガーゼ・プラスミド(ベクター)による組換え DNA のつくり方、薬剤耐性遺伝子による形質転換体の選択、真核生物の遺伝子を大腸菌で発現させるのに cDNA(逆転写酵素)を使う理由を説明する記述を選べる
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ある生物の遺伝子を取り出して別の生物の細胞に入れ、はたらかせる技術を遺伝子組換えといいます。この技能では、制限酵素で DNA を切り、DNA リガーゼでプラスミドにつなぐ手順、遺伝子を取りこんだ大腸菌だけを薬剤耐性遺伝子を手がかりに選び出す方法、ヒトなど真核生物の遺伝子を大腸菌で発現させるときに cDNA を使う理由について、正しい記述を選べるようになります。ヒトのインスリンなどを大腸菌に作らせる技術のしくみを理解するときに使います。
遺伝子組換えでは、目的の遺伝子を含む DNA 断片を、細胞の中で増えることのできる運び役の DNA(ベクター)につなぎます。大腸菌でよく使うベクターは、大腸菌の染色体とは別にある小さな環状の DNA であるプラスミドです。DNA を切るのに使うのが制限酵素で、それぞれの制限酵素は DNA の特定の塩基配列(多くは 4〜8 塩基対)を認識して、その場所だけを切断します。2 本の鎖で切る位置が少しずれる制限酵素で切ると、切り口に短い 1 本鎖の部分が突き出します。同じ制限酵素で目的の遺伝子を含む DNA とプラスミドを切れば、両方の切り口の 1 本鎖の部分は相補的になるので、塩基どうしが水素結合で対をつくって合わさります。そこを DNA リガーゼでつなぐと、ヌクレオチドどうしがつながった 1 本の組換え DNA ができあがります。
組換えたプラスミドを大腸菌の集団に入れても、実際にプラスミドを取りこむ大腸菌はごく一部です。そこで、抗生物質(たとえばアンピシリン)が効かなくなる薬剤耐性遺伝子をもつプラスミドを使います。処理後の大腸菌をその抗生物質を含む培地で培養すると、プラスミドを取りこんだ大腸菌は薬剤耐性遺伝子が発現して増えられますが、取りこまなかった大腸菌は増えられません。こうして、プラスミドを取りこんで性質が変わった大腸菌(形質転換した大腸菌)だけを選び出せます。
真核生物の遺伝子の多くは、DNA の中にイントロンを含んでいて、転写のあとスプライシングによってイントロンが取り除かれ、エキソンだけがつながった mRNA ができます。ところが原核生物の大腸菌にはスプライシングのしくみがないので、真核生物のゲノムの DNA をそのまま入れると、イントロンの部分まで翻訳に使われてしまい、正しいタンパク質ができません。そこで、スプライシングを終えた成熟 mRNA を取り出し、逆転写酵素(RNA を鋳型にして DNA を合成する酵素)で相補的な DNA を合成します。これを cDNA といいます。cDNA はイントロンを含まないので、大腸菌に入れても正しいアミノ酸配列のタンパク質を作らせることができます。
DNA を切る段階では、制限酵素が特定の塩基配列を認識して切ることを確かめる。目的の DNA とプラスミドは同じ制限酵素で切る(切り口が相補的になる)
DNA をつなぐ段階では、切り口どうしを合わせたあと、DNA リガーゼがつなぐことを確かめる(切るのは制限酵素、つなぐのは DNA リガーゼ)
組換えたプラスミドを大腸菌に入れ、プラスミドがもつ薬剤耐性遺伝子に対応する抗生物質を含む培地で培養する。生き残って増えた大腸菌が、プラスミドを取りこんだものである
真核生物の遺伝子を大腸菌で発現させる記述では、「大腸菌にはスプライシングのしくみがない」→「イントロンを含まない cDNA を使う」→「cDNA は成熟 mRNA から逆転写酵素で合成する」というつながりに合っているかを確かめる
ヒトのある遺伝子を大腸菌に導入して、そのタンパク質を大腸菌に合成させたい。このとき、ヒトの細胞から抽出したゲノムの DNA ではなく、mRNA をもとに合成した cDNA を用いる理由として最も適当なものを、次のア〜エのうちから 1 つ選べ。
ア 大腸菌は RNA ポリメラーゼをもたないので、ヒトの遺伝子を転写できないから。
イ 大腸菌にはスプライシングのしくみがないので、イントロンを含む遺伝子からは正しいタンパク質が合成されないから。
ウ cDNA は 1 本鎖の RNA なので、制限酵素で切断されずにプラスミドに組みこめるから。
エ ゲノムの DNA は DNA リガーゼでつなぐことができないが、cDNA はつなぐことができるから。
手順 4:真核生物の遺伝子を大腸菌で発現させるときに cDNA を使う理由を、「スプライシング → イントロン → cDNA」のつながりで確かめる。
ア:大腸菌も RNA ポリメラーゼをもち、自分の遺伝子を転写している。よって誤り。
イ:ヒトの遺伝子の多くはイントロンを含み、ヒトの細胞ではスプライシングでイントロンが除かれる。大腸菌にはスプライシングのしくみがないので、ゲノムの DNA をそのまま入れるとイントロンの部分まで翻訳に使われ、正しいタンパク質ができない。成熟 mRNA から逆転写酵素で合成した cDNA はイントロンを含まないので、この問題が起こらない。よって正しい。
ウ:cDNA は逆転写酵素で合成した DNA であり、RNA ではない。よって誤り。
エ(手順 2):DNA リガーゼは DNA の切り口どうしをつなぐ酵素で、ゲノムの DNA の断片もつなぐことができる。よって誤り。
以上より、最も適当なものはイである。
答え: イ
制限酵素と DNA リガーゼのはたらきを取り違える誤り。正しくは、制限酵素は特定の塩基配列を認識して DNA を切断する酵素、DNA リガーゼは DNA の切り口どうしをつなぐ酵素である
目的の DNA とプラスミドを別々の制限酵素で切ってもよい、としてしまう誤り。正しくは、切り口の 1 本鎖の部分が相補的になるように、ふつうは同じ制限酵素で両方を切る
抗生物質を含む培地で生き残った大腸菌は、もともと抗生物質に強い大腸菌である、としてしまう誤り。正しくは、薬剤耐性遺伝子をもつプラスミドを取りこんだ大腸菌だけがその抗生物質のもとで増えられるので、生き残った大腸菌はプラスミドを取りこんだものと判断できる
cDNA は DNA を鋳型にして合成する、あるいは cDNA にもイントロンが含まれる、としてしまう誤り。正しくは、cDNA はスプライシングを終えた成熟 mRNA を鋳型にして逆転写酵素で合成するので、イントロンを含まない
この説明は AI が書き、別の AI が例題を独立に解いて答えを確かめ、説明を一歩ずつ査読しました。
アンピシリン耐性遺伝子をもつプラスミドに、オワンクラゲの緑色蛍光タンパク質(GFP)の遺伝子を組み込み、組換えプラスミド Q をつくった。GFP 遺伝子は、アンピシリン耐性遺伝子とは別の位置に、大腸菌の中で発現できるように組み込まれている。用いた大腸菌は、アンピシリン耐性をもたず、GFP の遺伝子ももたない。
この大腸菌を次の 2 通りに処理した。
それぞれの大腸菌の液を、アンピシリンを含まない培地 A と、アンピシリンを含む培地 B に同じ量ずつまいて培養した。その後、生じたコロニーの数を数え、紫外線を当てて緑色の蛍光を発するかどうかを調べた。結果は次の表のとおりであった。
| 培地 A(アンピシリンなし) | 培地 B(アンピシリンあり) | |
|---|---|---|
| 処理 1 | 約 1000 個。そのうち約 20 個だけが蛍光を発し、残りは発しなかった | 約 20 個。すべて蛍光を発した |
| 処理 2 | 約 1000 個。すべて蛍光を発しなかった | 0 個 |
この実験の結果から考えられることとして最も適当なものを、次のア〜オのうちから 1 つ選べ。
ヒトのインスリンを大腸菌につくらせたい。ヒトの細胞の核から取り出した DNA のうち、インスリン遺伝子の領域をそのままプラスミドに組み込んで大腸菌に導入しても、正しいアミノ酸配列をもつインスリンはつくられない。
そこで、インスリンをさかんに合成しているヒトのすい臓の細胞から mRNA を抽出し、これを鋳型として逆転写酵素を用いて DNA を合成する。さらにこの DNA を 2 本鎖にしてプラスミドに組み込み、大腸菌に導入すると、正しいアミノ酸配列をもつインスリンがつくられる。
このように、mRNA を鋳型として逆転写酵素によって合成される DNA を何というか。