遺伝情報とその発現(知識)の問題
大腸菌の DNA 複製のしくみを調べるため、次の実験を行った。
【実験】 増殖中の大腸菌に、放射性同位体で標識したチミジン(DNA の材料となるヌクレオシド)を 10 秒間だけ与えた。その直後に、一部の菌から DNA を抽出した(試料 1)。残りの菌には、標識していないチミジンを大量に加えてさらに 5 分間培養し、DNA を抽出した(試料 2)。抽出した DNA は加熱して 1 本鎖にほどき、放射能をもつ(標識チミジンを取り込んだ)1 本鎖がどのくらいの長さかを調べた。同じ操作を、ある 1 種類の酵素の遺伝子に変異があってその酵素がはたらかない変異株 X でも行った。結果を次の表に示す。
| 菌 | 試料 1(標識直後) | 試料 2(5 分間培養後) |
|---|---|---|
| 野生型 | 放射能のおよそ半分が約 1000〜2000 ヌクレオチドの短い 1 本鎖に、残りが非常に長い 1 本鎖にあった | 放射能のほとんどが非常に長い 1 本鎖にあった |
| 変異株 X | 野生型と同様、放射能のおよそ半分が短い 1 本鎖に、残りが非常に長い 1 本鎖にあった | 放射能のおよそ半分が短い 1 本鎖にあるままだった |
この実験の結果と、DNA の複製のしくみについての知識から考えられることとして最も適当なものを、次のア〜オから 1 つ選べ。
- ア 短い 1 本鎖は、DNA ポリメラーゼが新生鎖を 3′ 末端から 5′ 末端の方向へ伸長させるために生じ、変異株 X では断片どうしを連結する酵素がはたらいていない。
- イ 短い 1 本鎖は、いったん合成された長い新生鎖が切断されて生じたもので、変異株 X では断片どうしを連結する酵素がはたらいていない。
- ウ 短い 1 本鎖は、2 本の新生鎖のうち一方だけで不連続に合成されて生じ、変異株 X では断片どうしを連結する酵素がはたらいていない。
- エ 短い 1 本鎖は、2 本の新生鎖の両方で同じように不連続に合成されて生じ、変異株 X では断片どうしを連結する酵素がはたらいていない。
- オ 短い 1 本鎖は、2 本の新生鎖のうち一方だけで不連続に合成されて生じ、変異株 X では DNA ポリメラーゼがはたらいていない。
この問題で使うもの
- DNA の複製のしくみ(説明と入口の問題)
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- DNA の複製のしくみ
ヒント
行き詰まったら、上から順に 1 つずつ開いてください。
ヒント 1
標識直後(試料 1)と 5 分後(試料 2)で、放射能をもつ 1 本鎖の長さがどう変わったかを、野生型と変異株 X で比べよう。
ヒント 2
DNA ポリメラーゼは新生鎖を 5′→3′ の方向にしか伸ばせないので、2 本の新生鎖のうち片方は連続的に、もう片方は短い断片として合成され、断片は DNA リガーゼでつながれる。
ヒント 3
標識直後に放射能の約半分が長い鎖にあることから、両方の新生鎖が不連続とするエは除ける。また、変異株 X でも標識が取り込まれていることから、どの過程が正常でどの過程が失われているかを考えると、選択肢はイ・ウのどちらかまで絞れる。あとは、野生型で標識が短い鎖と長い鎖のどちらからどちらへ移ったかを確かめよう。
答えと解説
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ウ
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解説を読む
【実験結果の読み取り】
(1) 野生型の試料 1 では、短時間に取り込まれた標識のおよそ半分が短い 1 本鎖(約 1000〜2000 ヌクレオチド)に、残りが非常に長い 1 本鎖にあった。つまり、新しく合成された DNA の半分は短い断片としてつくられ、残り半分は長い鎖に続けてつながる形でつくられている。
(2) 野生型の試料 2 では、標識のほとんどが長い 1 本鎖に移った。標識した部分は 10 秒間に合成された部分だけなので、短い断片は時間がたつと互いにつながって長い鎖になる、つまり短い断片は長い鎖の前段階(前駆体)であることがわかる。
(3) 変異株 X の試料 1 は野生型と同じなので、X でもヌクレオチドを取り込んで新生鎖を合成すること(DNA ポリメラーゼのはたらき)は正常に行われている。一方、試料 2 でも短い 1 本鎖が残ったので、X では短い断片どうしをつなぐ過程がはたらいていない。
【知識との対応】
DNA ポリメラーゼは新生鎖を 5′→3′ の方向にしか伸長できない。2 本の鋳型鎖は逆向きなので、複製フォークが開く向きに連続して合成される新生鎖(リーディング鎖)と、フォークと逆向きに短い断片(岡崎フラグメント)として不連続に合成される新生鎖(ラギング鎖)ができる。岡崎フラグメントは DNA リガーゼによって連結され、長い鎖になる。表の結果はこのしくみとよく合い、変異株 X は DNA リガーゼがはたらかない株と考えられる。よって正解はウである。
【ほかの選択肢】
- ア:DNA ポリメラーゼが新生鎖を伸長させる方向は 5′→3′ であり、「3′ 末端から 5′ 末端の方向」は誤り。
- イ:もし長い新生鎖が切断されて短い断片ができるのなら、標識は時間とともに長い鎖から短い鎖へ移るはずである。しかし野生型では、標識直後に短い断片にあった標識が、5 分後にはほとんど長い鎖に移っている。標識が短い鎖から長い鎖へ移るという前駆体と産物の関係から、短い断片は合成の途中段階であり、長い鎖が切断されてできたものではないとわかる。
- エ:両方の新生鎖が不連続に合成されるなら、標識直後のほぼすべての放射能が短い 1 本鎖に見られるはずだが、実際には約半分が長い 1 本鎖にあった。リーディング鎖は連続的に合成されるので誤り。
- オ:変異株 X でも標識直後に野生型と同様に標識が DNA に取り込まれているので、新生鎖の合成(DNA ポリメラーゼのはたらき)は失われていない。失われているのは断片の連結である。
別解
試料1では放射能の約半分が短い1本鎖(約1000〜2000ヌクレオチド)、残りが非常に長い1本鎖にあった。これは岡崎フラグメントの特徴と合う。複製では、リーディング鎖は連続的に合成され、ラギング鎖は不連続に合成される。2本の新生鎖のうち一方(ラギング鎖)だけが短い断片になるので、約半分の放射能が短い断片に、残りが長い鎖にあるという結果と一致する。野生型は5分後にほとんどが長い鎖になっており、断片が連結されたことがわかる。変異株Xでは短い断片が残ったままなので、断片をつなぐ酵素(DNAリガーゼ)がはたらいていないと考えられる。
各選択肢の検討:
ア:DNAポリメラーゼは新生鎖を5′→3′方向にしか伸長させない。「3′末端から5′末端の方向」は誤り。
イ:短い断片は長い鎖が切断されたものではなく、短いまま合成されたものである。野生型で標識直後でも短い鎖があり、かつ時間とともに連結される結果とも合わない。誤り。
ウ:一方の鎖(ラギング鎖)だけが不連続合成で、変異株Xでは連結酵素が欠損している。正しい。
エ:両方の新生鎖が不連続に合成されるなら、放射能の大部分が短い鎖にあるはずで、約半分という結果と合わない。誤り。
オ:DNAポリメラーゼがはたらかなければ、短い断片も長い鎖も合成されない。誤り。
よって正解はウ。