代謝の問題
ある酵素 E を使い、基質濃度を変えて反応の初速度(反応開始直後の生成物の生成速度)を測定した。温度と pH は常に一定で、最適条件に保った。酵素濃度は、実験 1 での濃度を 1.0 とした相対値で表す。
実験 1:酵素濃度 1.0、阻害物質なし
| 基質濃度 (mmol/L) | 1 | 2 | 4 | 6 | 10 | 18 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 初速度 (μmol/分) | 20 | 30 | 40 | 45 | 50 | 54 |
実験 2:酵素濃度 2.0、阻害物質なし
| 基質濃度 (mmol/L) | 1 | 10 |
|---|---|---|
| 初速度 (μmol/分) | 40 | 100 |
実験 3:酵素濃度 1.0、阻害物質 Y を一定濃度で加えた
| 基質濃度 (mmol/L) | 2 | 4 | 8 | 20 | 36 |
|---|---|---|---|---|---|
| 初速度 (μmol/分) | 20 | 30 | 40 | 50 | 54 |
次のことを前提とする。
- 実験 1 と実験 3 の結果から読み取れる基質濃度と初速度の関係の規則性は、表に示されていない基質濃度でも成り立つ。
- 阻害物質 Y の有無にかかわらず、同じ基質濃度での初速度は酵素濃度に比例する(実験 2 の結果はこのことを示している)。
酵素濃度を 2.0 とし、阻害物質 Y を実験 3 と同じ濃度で加えたとき、初速度が 90 μmol/分 となるのは基質濃度が何 mmol/L のときか。整数で答えよ。
この問題で使うもの
- 阻害物質を加えたときの反応速度(説明と入口の問題)
- 酵素濃度と反応速度(説明と入口の問題)
- 基質濃度と酵素反応の速度(説明と入口の問題)
この問題を解けるようになるまで(65 技能)
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- 阻害物質を加えたときの反応速度
- 酵素濃度と反応速度
ヒント
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ヒント 1
酵素濃度を変えた効果と、阻害物質 Y の効果を分けて考えよう。まず、酵素濃度 2.0 で 90 μmol/分 という条件を、酵素濃度 1.0 での条件に直してみる。
ヒント 2
実験 3 の各初速度が、実験 1 ではどの基質濃度で得られているかを比べてみよう。Y があるときとないときで、同じ初速度を得るのに必要な基質濃度の比が一定になっている。
ヒント 3
初速度は酵素濃度に比例するので、酵素濃度 1.0・Y ありで初速度 45 μmol/分 となる基質濃度を求めればよい。実験 1 では、初速度 45 μmol/分 は基質濃度 6 mmol/L で得られている。
答えと解説
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解説を読む
1. 酵素濃度と初速度の関係
実験 2 では、基質濃度 1 mmol/L で 40 μmol/分、10 mmol/L で 100 μmol/分であり、実験 1 の同じ基質濃度での値(20, 50)のちょうど 2 倍である。基質が酵素に比べて十分多いときは、酵素濃度が 2 倍になると、基質と結合して酵素–基質複合体をつくる酵素の量も 2 倍になるので、初速度も 2 倍になる。前提により、この比例関係は阻害物質 Y があるときも成り立つ。
したがって、酵素濃度 2.0・Y ありで初速度 90 μmol/分 となる基質濃度は、酵素濃度 1.0・Y ありで初速度
となる基質濃度に等しい。
2. 阻害物質 Y の作用の規則性
実験 3 と実験 1 を比べると、次のように対応している。
| 実験 3 の基質濃度 | 2 | 4 | 8 | 20 | 36 |
|---|---|---|---|---|---|
| 初速度 | 20 | 30 | 40 | 50 | 54 |
| 実験 1 で同じ初速度になる基質濃度 | 1 | 2 | 4 | 10 | 18 |
どの初速度でも、Y があるときは Y がないときのちょうど 2 倍の基質濃度が必要である。基質濃度を上げると Y の影響は打ち消されていき、高濃度では初速度が Y なしの最大付近(50〜54)に近づく。これは、Y が基質と活性部位を奪い合う競争的阻害の特徴である。Y があるときは、基質濃度が Y なしの半分の条件と同じ速さで反応が進むと考えればよい。
3. 答えを求める
実験 1 より、Y なし・酵素濃度 1.0 で初速度 45 μmol/分 となる基質濃度は 6 mmol/L である。2 の規則性(前提により表にない基質濃度でも成り立つ)から、Y ありで同じ初速度 45 μmol/分 を得るには、その 2 倍の
の基質濃度が必要である。
1 より、酵素濃度を 2.0 にするとこの基質濃度で初速度は μmol/分 となる。初速度は基質濃度とともに増加し続けるので、90 μmol/分 となる基質濃度はこれ 1 つに決まる。
答え:12 mmol/L
別解
実験1のデータは に合う。、 とすると、S=1 で 60/3=20、S=2 で 120/4=30、S=4 で 240/6=40、S=6 で 360/8=45、S=10 で 600/12=50、S=18 で 1080/20=54 となり、すべて表と一致する。
実験3は、最大速度が 60 のまま、初速度が最大の半分(30)になる基質濃度が 4 になっている。競争的阻害で見かけの とすると、S=2 で 120/6=20、S=4 で 240/8=30、S=8 で 480/12=40、S=20 で 1200/24=50、S=36 で 2160/40=54 となり、すべて表と一致する。
実験2は酵素濃度 2.0 で、S=1 で 2×20=40、S=10 で 2×50=100 となり、初速度が酵素濃度に比例することと合う。
酵素濃度 2.0、阻害物質 Y ありのときは、 となる。これを 90 とおくと、 より 、よって 。
検算:S=12 のとき となり、条件を満たす。