反応速度論の問題
一定温度・一定体積の水溶液中で、酵素 E が基質 S を生成物 P に変える不可逆反応
を触媒する。生成物 P は E に結合して EP をつくる競合阻害剤としてはたらき、 の解離定数は である(EP は反応しない)。この酵素の S に対するミカエリス定数は 、触媒定数は である。
酵素の全濃度 、基質の初濃度 、生成物の初濃度 で反応を開始した。反応の全過程で定常状態近似が成り立ち、P の結合平衡は常に成り立っているとする。また は に比べて十分小さいので、ES・EP として存在する S・P の量は無視でき、 とみなせる。酵素は反応中に失活しないものとする。
基質の が P に変換されるまでの時間は何分か。有効数字 3 桁で求めよ。必要なら を用いよ。
この問題で使うもの
- 酵素反応の積分形(説明と入口の問題)
- ミカエリス・メンテンの式(説明と入口の問題)
- 酵素反応の阻害(説明と入口の問題)
この問題を解けるようになるまで(60 技能)
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ヒント
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ヒント 1
P は競合阻害剤なので、見かけのミカエリス定数が になります。 を で表すと、 だけの微分方程式になります。
ヒント 2
を変数分離します。分母は の形の一次式です。
ヒント 3
積分すると が得られます。ここで 、、 です。
答えと解説
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解説を読む
速度式 競合阻害剤 P が存在するとき、定常状態近似と P の結合平衡から、酵素の物質収支 、、 より
となる。したがって
である。
積分 を代入すると分母は
となる。、 とおくと
である。 で として積分すると
数値 単位を mM とすると 、 である。80 % 変換では なので 、 である。よって
となる。また
であるから
となる。
(参考:P による阻害がなければ であり、生成物阻害によって変換が大きく遅れることがわかる。)
別解
P は競合阻害剤なので、見かけのミカエリス定数は となる。速度は である。
(mM)とおくと である。分母は となる。
最大速度は である。
よって となる。変数分離して積分すると
が得られる。
80 % 変換時は mM、 mM である。
mM。
分。
検算: と での速度は、 で 、 で となる。平均的な速度は約 程度で、 s と同程度であり、結果と矛盾しない。
答え:約 51.0 分。